二战风云2中运输船无法直接装载盟友部队，需通过部队转移、协同登陆、军团共享运输权限三种间接方式实现盟友部队的跨海运输部署，核心是依托港口与运输船的协同操作，配合军团与同盟机制完成跨玩家部队调度。
实现盟友部队运输的基础是确保双方处于同盟或同军团状态，先让盟友将待运输部队集结至己方控制的港口城市，该港口需满足运输船停靠与部队登船的基础条件，港口等级越高，单次可承载的部队吨位越大，能容纳坦克、装甲车等重型单位的数量越多。随后操控己方运输船停靠至该港口，选中运输船后开启装载界面，此时可看到港口内所有己方与盟友部队的列表，按部队类型与吨位合理分配，步兵单位占用吨位小，可批量装载，重型装甲与火炮单位占用吨位大，需计算运输船的总载重上限，避免超载导致无法启航，装载完成后运输船即可携带盟友部队向目标海域或海岸移动。
若盟友部队无法直接登船，可采用部队临时转移的方式，盟友先将部队转移至己方城市，转移操作需在军团界面的部队调度功能中完成，确认转移后部队会归属己方指挥，此时再将转移后的部队集结到港口，按常规装载流程装上运输船，抵达目标地点后，再通过部队回退功能将部队控制权归还盟友，这种方式适合远距离跨海域的大规模部队运输，能有效避免直接装载时的权限限制，但要注意转移期间的部队安全，防止被敌方突袭。
协同登陆运输是更实用的实战方式，己方负责提供运输船与护航舰队，盟友负责提供作战部队，双方提前沟通登陆点与航线，盟友将部队移动至己方指定的出发港口，己方运输船在港口待命，同时派遣驱逐舰、巡洋舰组成护航编队，提前清理航线周边的敌方潜艇、战舰与防空火力，确保运输航线安全。装载时由己方操作运输船完成盟友部队的登船，编队航行过程中保持护航舰只与运输船的阵型，抵达目标海岸后，运输船会自动释放盟友部队完成登陆，登陆后部队立即恢复盟友的指挥权限，可直接投入战斗，这种方式适合跨海突袭与前线增援，能最大化发挥运输船的运载能力与盟友部队的作战优势。
军团运输权限共享是高阶玩法，加入同一军团后，可在军团军需处开启运输共享功能，开启后军团内所有玩家的运输船可在指定港口互相装载部队，无需反复进行部队转移。操作时先在军团界面设置共享运输的港口范围，盟友部队直接进入共享港口，己方运输船停靠后即可直接装载，运输至目标港口后，盟友部队可直接下船归建，这种模式适合军团内的大规模协同作战，能快速实现多玩家部队的跨海域集结，提升整体作战效率，同时要注意合理规划运输船的调度，避免多支部队争抢运输资源导致运输延误。
