在帝国时代2中，每个文明都有其独特的英雄单位，有的甚至是从历史或传说中提取的人物。这些英雄不仅拥有独特的外观，还具备一些普通单位所不具备的特殊能力或更高的属性。在游戏的后期阶段，英雄单位可以成为决定游戏赢负的关键。
在讨论帝国时代2后期最强英雄之前，我们首先要理解，游戏中的英雄单位在不同的环境和对阵不同文明的策略中，其效力可能会有所不同。但以下是一些公认的在多数情形下都非常强大的英雄单位，可以在游戏后期扮演重要角色。
吕布（Lu Bu） 来自征服者扩展包中的一位非常强力的骑兵英雄。吕布拥有极高的攻击力和生命值，他能快速穿透敌军的防线，尤其是在与敌方的重装单位对抗时表现出色。他的高移动速度和强大的单点伤害使他成为一名游戏中的关键攻坚手。
威廉·华莱士（William Wallace） 他是游戏训练模式中的英雄，也在实际游戏中以高级步兵的形式出现。威廉·华莱士具有很高的生命值和攻击力，能在前线提供非常稳固的防护，并可以有效抵抗骑兵冲击。
查理曼（Charlemagne） 他是一名非常全面的步兵英雄，拥有在对抗建筑物时额外的攻击加成。查理曼的存在可以有效压制敌人的防御建设，为友军提供推进的空间。
岳飞（Yue Fei） 岳飞是一个非常均衡的步骑兼备英雄，在防御和进攻时都表现优异。他在对抗步兵时有额外的攻击力，同时对骑兵也有很好的抵抗力，非常适合在多变的战场环境中使用。
埃尔西德（El Cid） 作为骑兵英雄，埃尔西德在游戏后期尤为出色。他不仅拥有很高的生命值和攻击力，还能有效对抗建筑物和步兵。埃尔西德的强大在于他的多功能性，可以作为突击力量或者防御核心。
除了拥有高攻击和生命值的英雄之外，提升这些英雄的能力也非常关键。游戏中的英雄可以通过多种途径升级，包括研究技术、升级时代以及利用特定文明的独特优势。某些文明可以提升特定单位类型的攻击力和抗性，而这些升级往往可以使英雄单位的战斗能力大幅提升。
合理的战术安排也是游戏后期使用英雄的关键。英雄单位虽强，但不可孤军奋战，合理的部队配合和战术运用可以发挥出英雄单位的最大效力。例如在华莱士的坚固步兵防线配合高攻击的吕布进行突袭，可以在战略上形成强大的冲击力和防御力。
